La triplicació del genoma va lliurar al tomàquet de l’extinció

EFE

El tomàquet va superar una etapa en la que van morir el 75% de les espècies, entre altres els dinosaures. Els científics han trobat el motiu gràcies a la seqüenciació de l’ADN del tomàquet. Es tracta d’una investigació d’un consorci internacional de més de 300 científics de tretze països, entre ells investigadors catalans, del Centre de Regulació Genòmica (CRG) i del CSIC a València. Els resultats d’aquest treball es publiquen avui a la revista Nature i descriu les principals característiques del genoma del tomàquet domèstic (Solanum lycopersicum) en comparació del silvestre (Solanum pimpinellifolium) i la patata (Solanum tuberosum).
L’estudi conclou que els gens repetits que presenta el tomàquet indica que aquest va patir diverses triplicaciones consecutives fa uns 60 milions d’anys i explicarien algunes de les característiques d’aquest fruit i el seu èxit evolutiu. Segons explica l’investigador Antoni Granell, de l’Institut de Biologia Molecular i Cel · lular de Plantes Primo Yúfera (Centre del CSIC de la Universitat de València), que ha dirigit la part espanyola de la investigació, aquesta triplicació va fer que l’espècie sobrevisqués.

Informació per millorar els tomàquets

L’objectiu d’aquest treball, que descriu les regions del genoma del tomàquet que han estat clau per la seva evolució i especialització, és oferir el genoma del tomàquet a grups de recerca per a un millor coneixement de la biologia d’aquest vegetal, essencial en l’agricultura. L’ADN del tomàquet té uns 35.000 gens que s’expressen en uns 900 milions de parells de bases. Entre els seus diferents cadenes d’adenina, guanina, citosina, i timina, el tomàquet presenta indicis de l’haver patit diverses duplicacions, “un mecanisme per generar noves característiques “, assenyala Granell.
Per exemple, s’ha vist que alguns dels fragments repetits inclouen gens que serien responsables del control de certes característiques del fruit com la formació de la pell, pel que aquestes repeticions haurien contribuït a formar una pell més resistent per conservar millor el fruit.

En comparar els genomes de les espècies, els investigadors han observat que el genoma del tomàquet de cultiu i el silvestre només divergeixen un 0,6% (només sis canvis cada 1.000 nucleòtids, el que indicaria que les dues espècies es van separar fa uns 1,3 milions d’anys) mentre que la divergència amb la patata és de més del 8%, perquè durant l’evolució s’han invertit i repetit fragments llargs del genoma.

“El tomàquet és un dels cultius més comuns i de major explotació. Conèixer el seu genoma als detalls ens permet, d’una banda, entendre millor l’evolució de les plantes superiors gràcies a poblacions controlades com són les conreades i, d’altra, ens ofereix noves eines per a l’agricultura “, explica l’investigador Francisco Cámara, que ha participat en el projecte des del laboratori Bioinformàtica i Genòmica del CRG, liderat per Roderic Guigó. Aquest laboratori del CRG s’ha encarregat de desenvolupar el programari per identificar gens en la seqüència del genoma del tomàquet. A Catalunya també han participat el Barcelona Supercomputing Center i l’Institut de Recerca Biomèdica de Barcelona (IRB).  També ha col·laborat l’empresa Sistemes Genòmics de Parc tecnològic de València.El projecte ha comptat amb el suport de la Fundació Genoma Espanya, Cajamar la Federació Espanyola de Productors Exportadors de Fruites i Hortalisses i la Fundació Sèneca, entre altres organismes.

20 comentaris

  • BillieRib

    19/04/2017 11:08

    From your fundamental options individuals make towards the cuttingedge of medical research, dubious medical care troubles make statements everyday. The areas of difference provide many possibilities for a powerful speech or dissertation. Several dilemmas concerning maternity, delivery and early childhood supply powerful prospects. Vaccinations, attachment parenting vs. enabling toddlers “weep it out,” breastfeeding and early toilet training are all places in which a little investigation can help you create a great persuasive discussion. Plenty of controversies surrounding adolescent health supply persuasive topic perspectives. Abstinence vs. openly accessible birth-control, if the drinking age should be transformed, at what age youngsters must be allowed to create wellness conclusions for themselves, and what wellness info physicians must be needed to share with a teen’s parents are reasons that both sides claim persuasive research. Political and Legitimate Medical Issues Therefore may the problem of whether surfaces should push visitors to recognize cure they don’t wish; probable subtopics contain vaccines, forced birth-control, psychiatric medicine, medicine rehab and stop-of-life treatment. Nutritional Medical Issues Diet controversies abound. Genetically modified plants are believed poison by some and also the answer to world starvation by others. Some genuinely believe that obesity is definitely a medical condition, while some argue.
    book reviews

  • Llathidanaccelemia

    15/04/2017 15:21

    Hello. And Bye.

  • Thomastug

    10/04/2017 2:38

    tickety-boo website! individualistic in in up the cyclopean work. visit my website only if you are overwhelming 21 check this sex toys portal

  • Auririnasymn

    09/04/2017 14:52

    Hello. And Bye.

  • Thomastug

    07/04/2017 4:37

    massive website! acclaim up the jumbo work. visit my website only if you are overwhelming 21 check this adult toys portal

  • Angelikaasymn

    05/04/2017 18:37

    Hello. And Bye.

  • JeremyTress

    31/03/2017 11:36

    love your website, thanks and keep the kind berth check the latest online casino bonus offers

  • JeremyTress

    26/03/2017 7:23

    relish your website, thanks and keep an eye on the honesty a possessions job check the latest casino bonus offers

  • JeremyTress

    19/03/2017 3:05

    attraction your website, thanks and camouflage b confine the honesty a possessions trade check the latest online casino bonus offers

  • JeremyTress

    17/03/2017 15:47

    relish your website, thanks and keep the kind berth check the latest online casino bonus offers

Comenta

*

(*) Camps obligatoris

L'enviament de comentaris implica l'acceptació de les normes d'ús